NSUN3 (Mitglied der NOP2/Sun RNA-Methyltransferase-Familie 3) ist ein Gen, das eine RNA-Methyltransferase kodiert, die an der Modifikation mitochondrialer tRNAs beteiligt ist. Diese Modifikation ist wichtig für die ordnungsgemäße mitochondriale Proteinsynthese und Funktion. Mutationen im NSUN3-Gen sind mit mitochondrialen Erkrankungen in Verbindung gebracht worden.